59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4191 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  54.12 
 
 
1025 aa  1104    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  59.1 
 
 
1041 aa  1254    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  43.64 
 
 
1035 aa  785    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  53.69 
 
 
1023 aa  1105    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  54.02 
 
 
1025 aa  1102    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  45.09 
 
 
1039 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  44.98 
 
 
1039 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  53.7 
 
 
1023 aa  1093    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  66.99 
 
 
1032 aa  1395    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  60.28 
 
 
1023 aa  1222    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  71.09 
 
 
1049 aa  1463    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  61.17 
 
 
1031 aa  1257    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  54.32 
 
 
1025 aa  1102    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  43.01 
 
 
1035 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  56.04 
 
 
1014 aa  1093    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  54.32 
 
 
1025 aa  1102    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  43.74 
 
 
1035 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  70.39 
 
 
1049 aa  1457    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  70.99 
 
 
1045 aa  1485    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  43.64 
 
 
1035 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  48.32 
 
 
1011 aa  915    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  48.36 
 
 
1024 aa  902    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
1035 aa  794    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  45.93 
 
 
1026 aa  833    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  45.38 
 
 
1019 aa  824    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  44.92 
 
 
1030 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  71.66 
 
 
1049 aa  1469    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  49.8 
 
 
1035 aa  931    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  100 
 
 
1045 aa  2134    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  92.15 
 
 
1045 aa  1964    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  46.67 
 
 
1008 aa  884    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  48.43 
 
 
1011 aa  915    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  46.02 
 
 
1066 aa  856    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  47.08 
 
 
1095 aa  851    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  44.98 
 
 
1038 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  73.67 
 
 
1029 aa  1576    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 
1035 aa  782    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  47.33 
 
 
1034 aa  896    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  49.59 
 
 
1014 aa  928    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  50.41 
 
 
1014 aa  935    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  45.99 
 
 
1026 aa  835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  52.44 
 
 
1010 aa  1058    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  47.3 
 
 
1001 aa  872    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  46.98 
 
 
1022 aa  849    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  43.64 
 
 
1035 aa  785    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  65.67 
 
 
1029 aa  1357    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  53.69 
 
 
1023 aa  1101    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  53.49 
 
 
1022 aa  1097    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  51.83 
 
 
1015 aa  1044    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  32.14 
 
 
786 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  33.06 
 
 
754 aa  47  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  28.31 
 
 
687 aa  47  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  27.04 
 
 
792 aa  45.8  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  27.04 
 
 
792 aa  45.8  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  27.22 
 
 
814 aa  45.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  28.36 
 
 
642 aa  45.8  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  27.61 
 
 
642 aa  45.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08800  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.58 
 
 
557 aa  45.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000196168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  24.84 
 
 
698 aa  44.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>