53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13960 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  63.62 
 
 		 1045 aa  1293    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  53.32 
 
 		 1025 aa  1060    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  49.38 
 
 		 1039 aa  851    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  49.18 
 
 		 1039 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  53.33 
 
 		 1023 aa  1051    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  67.25 
 
 		 1032 aa  1356    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  61.08 
 
 		 1023 aa  1191    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  63.08 
 
 		 1049 aa  1282    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  61.21 
 
 		 1031 aa  1238    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  53.62 
 
 		 1025 aa  1066    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  53.42 
 
 		 1025 aa  1059    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  46.84 
 
 		 1035 aa  817    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  62.5 
 
 		 1049 aa  1276    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  49.19 
 
 		 1035 aa  884    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  46.24 
 
 		 1035 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  50.4 
 
 		 1024 aa  906    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  45.51 
 
 		 1035 aa  820    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  47.08 
 
 		 1019 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  48.46 
 
 		 1026 aa  853    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  48 
 
 		 1011 aa  879    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  58.65 
 
 		 1014 aa  1080    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  53.32 
 
 		 1025 aa  1060    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  100 
 
 		 1029 aa  2072    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  49.95 
 
 		 1001 aa  890    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  48 
 
 		 1011 aa  881    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  46.24 
 
 		 1035 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  63.17 
 
 		 1049 aa  1283    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  65.67 
 
 		 1045 aa  1352    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  64.31 
 
 		 1045 aa  1323    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  46.19 
 
 		 1008 aa  835    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  45.07 
 
 		 1066 aa  803    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  47.34 
 
 		 1095 aa  830    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  49.28 
 
 		 1038 aa  852    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  63.6 
 
 		 1029 aa  1319    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  46.49 
 
 		 1035 aa  816    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  47.77 
 
 		 1034 aa  899    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  48.59 
 
 		 1030 aa  856    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 		 1014 aa  909    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  51.06 
 
 		 1014 aa  916    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  49.23 
 
 		 1026 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  53.6 
 
 		 1010 aa  1031    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  44.8 
 
 		 1022 aa  791    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  46.24 
 
 		 1035 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  54.02 
 
 		 1023 aa  1074    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  54.08 
 
 		 1022 aa  1074    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  51.79 
 
 		 1015 aa  1006    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  45.61 
 
 		 1035 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  60.89 
 
 		 1041 aa  1228    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  53.79 
 
 		 1023 aa  1067    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  28.66 
 
 		 665 aa  52.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.46 
 
 		 642 aa  49.3  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  30.95 
 
 		 642 aa  48.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  30.51 
 
 		 655 aa  47  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>