36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0929 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  35.11 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  32.26 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  34.92 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  29.55 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  36.71 
 
 		 745 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  33.98 
 
 		 215 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  29.6 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  30.51 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  34.15 
 
 		 746 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  28 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  35.56 
 
 		 288 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  27.72 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  33.64 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  34.44 
 
 		 741 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1515  hypothetical protein  39 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  27.62 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  31.65 
 
 		 745 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  31.48 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  32.73 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  38.24 
 
 		 412 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  31.36 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  27.1 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  31 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  31 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1363  hypothetical protein  36.99 
 
 		 160 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  34.04 
 
 		 201 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1423  hypothetical protein  36.99 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  32.39 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3225  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  29.29 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  23.62 
 
 		 127 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>