37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2681 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  100 
 
 
412 aa  845    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  37.27 
 
 
164 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  47.13 
 
 
166 aa  90.5  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  49.37 
 
 
136 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  43.68 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  43.37 
 
 
183 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  36.17 
 
 
269 aa  77  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  41.38 
 
 
288 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  37.86 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  33.7 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  36.36 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  40.45 
 
 
746 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  38.46 
 
 
745 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  29.81 
 
 
130 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  36.14 
 
 
745 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  36.17 
 
 
134 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  30.91 
 
 
132 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0769  hypothetical protein  35.96 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  35 
 
 
133 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  28.85 
 
 
130 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  36.36 
 
 
741 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  29.36 
 
 
130 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  32.63 
 
 
130 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  28.85 
 
 
130 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  29.17 
 
 
190 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  31.86 
 
 
176 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  32.91 
 
 
215 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  34.07 
 
 
123 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  33.33 
 
 
316 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  34.83 
 
 
123 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0065  hypothetical protein  35.06 
 
 
167 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0709944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  27.88 
 
 
130 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  26.67 
 
 
130 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1286  hypothetical protein  27.86 
 
 
232 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137099  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  38.24 
 
 
137 aa  47  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2396  hypothetical protein  31.25 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
503 aa  43.1  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>