29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2055 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  353  7.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  48.21 
 
 
288 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  45.95 
 
 
140 aa  101  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  35 
 
 
269 aa  93.2  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  31.03 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  40.96 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  33.54 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  36.63 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  33.7 
 
 
412 aa  67.8  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  36.84 
 
 
745 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  27.72 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  32.22 
 
 
745 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
503 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  37.84 
 
 
746 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  28.04 
 
 
215 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  34.41 
 
 
741 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  26.47 
 
 
246 aa  51.2  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  25.96 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  31.43 
 
 
139 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3225  hypothetical protein  29.17 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  31.48 
 
 
137 aa  48.5  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1691  hypothetical protein  40.58 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.411172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  25.71 
 
 
134 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  29.13 
 
 
812 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  29.13 
 
 
1202 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  35.14 
 
 
316 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  27.59 
 
 
117 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1515  hypothetical protein  29.9 
 
 
101 aa  41.6  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0065  hypothetical protein  28.57 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0709944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>