33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1409 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  100 
 
 
269 aa  543  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  58.04 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  35 
 
 
175 aa  92.4  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  36.23 
 
 
140 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  37 
 
 
166 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  40 
 
 
136 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  36.59 
 
 
164 aa  86.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  32.28 
 
 
153 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  33.33 
 
 
183 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  36.17 
 
 
412 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  36 
 
 
745 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  35 
 
 
745 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  38.82 
 
 
746 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  29.38 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  28.71 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  31.13 
 
 
215 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3479  hypothetical protein  36.46 
 
 
149 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.647985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  27.45 
 
 
134 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
503 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  30.51 
 
 
137 aa  52.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  31.91 
 
 
741 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  33.68 
 
 
129 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  32.58 
 
 
201 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  28.18 
 
 
130 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  27.86 
 
 
127 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  32.61 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  28.87 
 
 
130 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1515  hypothetical protein  30.11 
 
 
101 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  27.84 
 
 
130 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  28.77 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  27.96 
 
 
127 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  28.26 
 
 
130 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  32.5 
 
 
127 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>