31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0547 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0547  beta-propeller domain-containing protein  100 
 
 		 703 aa  1427    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000139284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  29.83 
 
 		 787 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1761  hypothetical protein  29.62 
 
 		 680 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1971  hypothetical protein  25.68 
 
 		 644 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3465  secreted protein  29.94 
 
 		 690 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  27.9 
 
 		 845 aa  163  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0353  hypothetical protein  26.02 
 
 		 635 aa  163  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116012  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1144  hypothetical protein  27.56 
 
 		 662 aa  162  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0471  copper amine oxidase-like protein  25.23 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0141512 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0009  secreted protein  25 
 
 		 636 aa  150  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00303672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3362  C-terminal beta- propeller domain-contain secreted protein-like protein  24.71 
 
 		 697 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2091  hypothetical protein  25.96 
 
 		 693 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2006  hypothetical protein  26.23 
 
 		 691 aa  133  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6043  Secreted protein  27.03 
 
 		 635 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.557993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4531  hypothetical protein  27.39 
 
 		 632 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.420063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3067  putative lipoprotein  23.13 
 
 		 698 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257296  normal  0.354742 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1856  hypothetical protein  25.22 
 
 		 690 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5041  hypothetical protein  25.18 
 
 		 625 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2127  hypothetical protein  26.5 
 
 		 652 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1174  Secreted protein containing C-terminal beta- propeller domain distantly related to WD-40 repeats-like protein  26.01 
 
 		 711 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  40.34 
 
 		 745 aa  100  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  40.34 
 
 		 746 aa  99.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  38.66 
 
 		 741 aa  98.2  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  38.66 
 
 		 745 aa  94.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1330  hypothetical protein  32.14 
 
 		 608 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.696713 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1498  hypothetical protein  37.59 
 
 		 682 aa  88.6  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2884  Beta propeller domain protein  28.26 
 
 		 685 aa  87.8  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2462  hypothetical protein  35.43 
 
 		 652 aa  82  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43674  predicted protein  29.05 
 
 		 854 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.300412  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1394  hypothetical protein  36.44 
 
 		 677 aa  73.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46646  normal  0.639448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6044  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1083 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.513636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>