31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1761 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1761  hypothetical protein  100 
 
 
680 aa  1401    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  49.92 
 
 
845 aa  623  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1144  hypothetical protein  45.21 
 
 
662 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3465  secreted protein  45.12 
 
 
690 aa  532  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0009  secreted protein  38.41 
 
 
636 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00303672  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0353  hypothetical protein  40.82 
 
 
635 aa  389  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116012  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1971  hypothetical protein  33.63 
 
 
644 aa  347  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3362  C-terminal beta- propeller domain-contain secreted protein-like protein  47.22 
 
 
697 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0179249  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0471  copper amine oxidase-like protein  31.12 
 
 
741 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0141512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2127  hypothetical protein  31.01 
 
 
652 aa  253  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3067  putative lipoprotein  26.76 
 
 
698 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257296  normal  0.354742 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  32.06 
 
 
745 aa  216  9e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  31.47 
 
 
745 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  31.33 
 
 
746 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6043  Secreted protein  30.89 
 
 
635 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.557993  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  51.31 
 
 
741 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4531  hypothetical protein  28.85 
 
 
632 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.420063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5041  hypothetical protein  28.91 
 
 
625 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2884  Beta propeller domain protein  27.51 
 
 
685 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83857  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1856  hypothetical protein  26.82 
 
 
690 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0547  beta-propeller domain-containing protein  29.11 
 
 
703 aa  173  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000139284  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2091  hypothetical protein  27.19 
 
 
693 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2006  hypothetical protein  24.68 
 
 
691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1174  Secreted protein containing C-terminal beta- propeller domain distantly related to WD-40 repeats-like protein  34.84 
 
 
711 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  25.68 
 
 
787 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2462  hypothetical protein  38.86 
 
 
652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1394  hypothetical protein  30.12 
 
 
677 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46646  normal  0.639448 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1498  hypothetical protein  36.25 
 
 
682 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1330  hypothetical protein  31.06 
 
 
608 aa  108  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.696713 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43674  predicted protein  23.42 
 
 
854 aa  95.1  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.300412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6044  hypothetical protein  24.37 
 
 
1083 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.513636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>