29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6044 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6044  hypothetical protein  100 
 
 
1083 aa  2227    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.513636  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1971  hypothetical protein  24.24 
 
 
644 aa  98.2  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1761  hypothetical protein  24.4 
 
 
680 aa  75.1  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0009  secreted protein  20.57 
 
 
636 aa  74.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00303672  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  28.99 
 
 
741 aa  74.3  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  27.5 
 
 
745 aa  71.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  28.07 
 
 
745 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1856  hypothetical protein  25.37 
 
 
690 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0471  copper amine oxidase-like protein  29.63 
 
 
741 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0141512 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  25.88 
 
 
746 aa  68.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0353  hypothetical protein  21.62 
 
 
635 aa  67.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4531  hypothetical protein  29.11 
 
 
632 aa  65.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.420063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2462  hypothetical protein  26.14 
 
 
652 aa  62.4  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0547  beta-propeller domain-containing protein  23.48 
 
 
703 aa  62.4  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000139284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1174  Secreted protein containing C-terminal beta- propeller domain distantly related to WD-40 repeats-like protein  25 
 
 
711 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3465  secreted protein  24.48 
 
 
690 aa  61.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1144  hypothetical protein  28.26 
 
 
662 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5041  hypothetical protein  25.63 
 
 
625 aa  60.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3362  C-terminal beta- propeller domain-contain secreted protein-like protein  21.78 
 
 
697 aa  60.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0179249  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2006  hypothetical protein  26.7 
 
 
691 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  25 
 
 
845 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2091  hypothetical protein  30.3 
 
 
693 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1394  hypothetical protein  26.11 
 
 
677 aa  56.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46646  normal  0.639448 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1498  hypothetical protein  20.82 
 
 
682 aa  55.5  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6043  Secreted protein  23.59 
 
 
635 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.557993  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2884  Beta propeller domain protein  25.78 
 
 
685 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83857  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43674  predicted protein  21.85 
 
 
854 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.300412  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1330  hypothetical protein  27.13 
 
 
608 aa  47  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.696713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2127  hypothetical protein  22.36 
 
 
652 aa  46.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>