31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4531 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5041  hypothetical protein  78.36 
 
 
625 aa  884    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4531  hypothetical protein  100 
 
 
632 aa  1254    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.420063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6043  Secreted protein  40.46 
 
 
635 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.557993  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1174  Secreted protein containing C-terminal beta- propeller domain distantly related to WD-40 repeats-like protein  50.35 
 
 
711 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2884  Beta propeller domain protein  38.04 
 
 
685 aa  250  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83857  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  27.14 
 
 
745 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1761  hypothetical protein  27.75 
 
 
680 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  26.53 
 
 
745 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  36.89 
 
 
741 aa  187  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  23.98 
 
 
845 aa  185  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  26.52 
 
 
746 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0353  hypothetical protein  28.32 
 
 
635 aa  172  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3067  putative lipoprotein  31.4 
 
 
698 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257296  normal  0.354742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3465  secreted protein  26.43 
 
 
690 aa  170  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1144  hypothetical protein  26.81 
 
 
662 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0009  secreted protein  23.31 
 
 
636 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00303672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1856  hypothetical protein  30.66 
 
 
690 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2127  hypothetical protein  25.89 
 
 
652 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1971  hypothetical protein  28.16 
 
 
644 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3362  C-terminal beta- propeller domain-contain secreted protein-like protein  33.78 
 
 
697 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0179249  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2091  hypothetical protein  31.2 
 
 
693 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2006  hypothetical protein  30.68 
 
 
691 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2462  hypothetical protein  25.56 
 
 
652 aa  150  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0471  copper amine oxidase-like protein  32.36 
 
 
741 aa  147  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0141512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0547  beta-propeller domain-containing protein  27.65 
 
 
703 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000139284  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1498  hypothetical protein  37.81 
 
 
682 aa  124  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1330  hypothetical protein  35.41 
 
 
608 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.696713 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43674  predicted protein  24.74 
 
 
854 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.300412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  54.95 
 
 
787 aa  104  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1394  hypothetical protein  30.07 
 
 
677 aa  101  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46646  normal  0.639448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6044  hypothetical protein  29.11 
 
 
1083 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.513636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>