17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3225 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3225  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  303  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  72.27 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  32.73 
 
 		 215 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  29.17 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  31.76 
 
 		 746 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  28.28 
 
 		 288 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  30.59 
 
 		 745 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  29.63 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  30.21 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  27.37 
 
 		 316 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  29.17 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  30.7 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  29.67 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  27.08 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1515  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  32.56 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>