48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0501 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  60.56 
 
 		 206 aa  231  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  59.14 
 
 		 212 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  54.77 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  58.06 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  58.06 
 
 		 212 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  56.45 
 
 		 212 aa  221  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  55.21 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  61.24 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  58.01 
 
 		 280 aa  207  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  51.7 
 
 		 193 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  49.21 
 
 		 230 aa  171  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  42.08 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  42.79 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  49.66 
 
 		 356 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  40.45 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  52.54 
 
 		 128 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  38.38 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  37.36 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  30.65 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  38.89 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  29.17 
 
 		 339 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  35.43 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  28.1 
 
 		 123 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  32.18 
 
 		 463 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  31.03 
 
 		 446 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  32.71 
 
 		 262 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  29.59 
 
 		 132 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  35.64 
 
 		 341 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  27.1 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  34.95 
 
 		 132 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  31.91 
 
 		 306 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  32.04 
 
 		 296 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  35.29 
 
 		 341 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  34.48 
 
 		 307 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  35.24 
 
 		 225 aa  44.7  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  44.7  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  25.78 
 
 		 405 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  28.85 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  28.85 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  28.85 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  28.85 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  28.85 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  28.87 
 
 		 277 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  39.06 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  32.35 
 
 		 122 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>