63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0757 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  434  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  43.72 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  36.13 
 
 
227 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  32.69 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  36.53 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  33.52 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  38.12 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  31.46 
 
 
212 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  32.2 
 
 
212 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  33.52 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  30.86 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  31.46 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  31.46 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  35.03 
 
 
280 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  37.59 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  29.89 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  34.91 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  34.15 
 
 
405 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  27.59 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  28.73 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  54.55 
 
 
245 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  36.36 
 
 
463 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  38.1 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  34.57 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  31.13 
 
 
254 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  33.94 
 
 
497 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  24.48 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  36.36 
 
 
340 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  32.29 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  28.04 
 
 
877 aa  48.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  48.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  29.91 
 
 
462 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  29.09 
 
 
192 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  33.33 
 
 
295 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  28.71 
 
 
262 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  35.24 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  34.38 
 
 
307 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  29.09 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  34.31 
 
 
341 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  26.27 
 
 
132 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  32.98 
 
 
266 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4397  tetratricopeptide TPR_2  34.69 
 
 
253 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 
434 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2054  hypothetical protein  31.86 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  30.95 
 
 
132 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  32.29 
 
 
479 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  52.78 
 
 
570 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  50 
 
 
413 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  27.73 
 
 
123 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.75 
 
 
446 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  31.33 
 
 
277 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  31.4 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  30.77 
 
 
272 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.91 
 
 
436 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0279976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>