74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1128 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  942    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  43.05 
 
 
479 aa  317  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  48.54 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  45.16 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  50.6 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  46.08 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  38.68 
 
 
123 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  37.21 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  38.89 
 
 
132 aa  68.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73390  hypothetical protein  43.75 
 
 
127 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00754906  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  41.46 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  36 
 
 
109 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  36 
 
 
109 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  36 
 
 
109 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  36 
 
 
109 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  36.54 
 
 
339 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  38.82 
 
 
111 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  39.56 
 
 
119 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  38.1 
 
 
99 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  37.08 
 
 
117 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  28.1 
 
 
277 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  32.95 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  38.36 
 
 
113 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  29.06 
 
 
128 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  36.99 
 
 
113 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  30.33 
 
 
877 aa  53.1  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  38.38 
 
 
266 aa  53.5  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  31.82 
 
 
212 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  35.71 
 
 
117 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  30.93 
 
 
212 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  38.24 
 
 
371 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  38.24 
 
 
377 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  28.97 
 
 
206 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  38.24 
 
 
390 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  38.36 
 
 
113 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  38.24 
 
 
385 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  38.24 
 
 
373 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  36.08 
 
 
245 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  38.24 
 
 
275 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  36.08 
 
 
245 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  35.35 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  38.24 
 
 
406 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  36.08 
 
 
245 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  35.64 
 
 
315 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  28.07 
 
 
230 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  28.45 
 
 
128 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  36.71 
 
 
307 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  30.59 
 
 
212 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  35.87 
 
 
100 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  30.59 
 
 
212 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  30.89 
 
 
557 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  29.91 
 
 
208 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  33.64 
 
 
211 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  29.57 
 
 
272 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  32.04 
 
 
197 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  29.21 
 
 
206 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  31.73 
 
 
132 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  36 
 
 
351 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  31.86 
 
 
129 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  32.48 
 
 
222 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  31.91 
 
 
203 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  31 
 
 
193 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  34.88 
 
 
306 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  34 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  37.5 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  32.5 
 
 
225 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  30.43 
 
 
221 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  28.87 
 
 
207 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 
434 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  38.68 
 
 
254 aa  43.9  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  23.17 
 
 
405 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  37.5 
 
 
254 aa  43.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>