42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3346 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  470  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  67.43 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  65.34 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  66.47 
 
 		 206 aa  247  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  65.14 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  66.47 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  64.57 
 
 		 212 aa  245  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  63.43 
 
 		 207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  63.69 
 
 		 280 aa  235  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  57.06 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  61.71 
 
 		 196 aa  214  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  53.98 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  47.92 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  48.35 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  42.72 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  42.69 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  65.96 
 
 		 128 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  36.13 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  34.02 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  29.73 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  39.8 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  39.33 
 
 		 497 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  40.82 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  38.3 
 
 		 306 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  37.07 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  38.82 
 
 		 463 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  35.71 
 
 		 339 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  41.33 
 
 		 339 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  35.24 
 
 		 405 aa  48.5  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  35.56 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  39.53 
 
 		 307 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  35.96 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  36.36 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  36.36 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  28.02 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  30.59 
 
 		 132 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  28.09 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  36.67 
 
 		 295 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  33.73 
 
 		 122 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  25.86 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  34.94 
 
 		 100 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>