29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4308 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4963  hypothetical protein  68.6 
 
 		 209 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.746383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4652  hypothetical protein  36.89 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0779138  normal  0.4298 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  67.78 
 
 		 570 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  61.8 
 
 		 244 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  51.2 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1973  hypothetical protein  30.63 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000272094  normal  0.719912 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  60.67 
 
 		 244 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5833  putative lipoprotein  49.19 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.077855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3898  putative lipoprotein  49.19 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4470  putative lipoprotein  49.19 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2243  putative lipoprotein  30 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  50.62 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.44 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  36.14 
 
 		 222 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  40.28 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  39.47 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  36.36 
 
 		 245 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  39.44 
 
 		 351 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  34.85 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  31.82 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  34.18 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  52.78 
 
 		 208 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  27.68 
 
 		 134 aa  43.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>