77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_7075 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  100 
 
 
245 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  96.33 
 
 
245 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  96.33 
 
 
245 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  75 
 
 
100 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  44.16 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34.48 
 
 
339 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  27.62 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  35.44 
 
 
341 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  41.25 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  36.71 
 
 
334 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  38.96 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  39.51 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  36.9 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  35.44 
 
 
497 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  34.52 
 
 
132 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  36.36 
 
 
413 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  35.44 
 
 
341 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  36.08 
 
 
462 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  31.76 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  31.33 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  31.17 
 
 
315 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  32.53 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  31.76 
 
 
212 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  33.73 
 
 
193 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  31.03 
 
 
214 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  37.04 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  35.71 
 
 
275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  35.71 
 
 
377 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  35.71 
 
 
385 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  21.28 
 
 
479 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  35.71 
 
 
371 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  35.71 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  35.06 
 
 
570 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  35.71 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  30.11 
 
 
111 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  33.65 
 
 
418 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  30.21 
 
 
129 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  34.18 
 
 
111 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  29.79 
 
 
197 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  30.95 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  35.71 
 
 
406 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  36.14 
 
 
356 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  34.18 
 
 
109 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  34.18 
 
 
109 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  34.18 
 
 
109 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  34.18 
 
 
109 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  34.18 
 
 
109 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  36.99 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  36.99 
 
 
295 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  29.87 
 
 
306 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  32.05 
 
 
166 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  31.76 
 
 
877 aa  46.2  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  29.76 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  32.53 
 
 
117 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  36.99 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  34.44 
 
 
405 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  32.39 
 
 
221 aa  45.4  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  27.08 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  29.76 
 
 
128 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  33.33 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  32.88 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  30 
 
 
117 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  35.44 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
436 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  32.18 
 
 
119 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4397  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  31.03 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  27.96 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2023  hypothetical protein  35.21 
 
 
716 aa  42  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  26.06 
 
 
339 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  25.86 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>