63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1492 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  73.33 
 
 
192 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  41.67 
 
 
206 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.94 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  43.9 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  40.86 
 
 
166 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  38.55 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  38.55 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  37.35 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  36.14 
 
 
413 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  37.21 
 
 
570 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  33.88 
 
 
122 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3898  putative lipoprotein  37.35 
 
 
291 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  35.09 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5833  putative lipoprotein  37.35 
 
 
291 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.077855  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4470  putative lipoprotein  37.35 
 
 
291 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  35.24 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  63.41 
 
 
341 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  40.62 
 
 
341 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  36.17 
 
 
277 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  37.14 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  34.38 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  38.78 
 
 
315 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  28.41 
 
 
334 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  32.38 
 
 
339 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  28.69 
 
 
877 aa  52  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  37 
 
 
111 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  35.29 
 
 
307 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  41.51 
 
 
446 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  34.29 
 
 
231 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  33.65 
 
 
132 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  29.8 
 
 
405 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  32.43 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  31.16 
 
 
462 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  32.32 
 
 
128 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  35.37 
 
 
497 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  32.22 
 
 
463 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  30.49 
 
 
296 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  25.6 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  31.19 
 
 
117 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  34.02 
 
 
306 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  31.87 
 
 
117 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  27.62 
 
 
109 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  27.62 
 
 
109 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  27.62 
 
 
109 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  27.62 
 
 
109 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  27.62 
 
 
109 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  29.65 
 
 
418 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  29.67 
 
 
132 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  25.17 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  28.46 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  31.96 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  40.32 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  35.44 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.23 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4274  hypothetical protein  36.56 
 
 
283 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.162287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  33.7 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  29.06 
 
 
117 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>