76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3205 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  726    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  39.05 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  41.94 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  38.64 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  36.36 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  28.09 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  29.46 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  30.43 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  34.09 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  38.96 
 
 		 245 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  33.33 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  32.56 
 
 		 109 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  32.56 
 
 		 109 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  32.56 
 
 		 109 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  32.56 
 
 		 109 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  32.56 
 
 		 109 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  38.96 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  38.96 
 
 		 245 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  38.55 
 
 		 132 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  37.97 
 
 		 111 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  44.59 
 
 		 416 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  30.26 
 
 		 307 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  37.08 
 
 		 240 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  34.57 
 
 		 122 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  32.43 
 
 		 479 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  37.08 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  38.96 
 
 		 100 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  31 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  28.28 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  34.94 
 
 		 117 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  32.47 
 
 		 463 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  36.36 
 
 		 262 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  36.08 
 
 		 245 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  26.71 
 
 		 437 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  30.88 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  31.88 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  30.53 
 
 		 481 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  29.89 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  37.65 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  31.33 
 
 		 193 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  28.37 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  32.47 
 
 		 119 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  35.16 
 
 		 576 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  28.86 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  38.75 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  39.44 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  26.58 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  29.25 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  36.84 
 
 		 111 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  36 
 
 		 462 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  29.21 
 
 		 206 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 497 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  29.21 
 
 		 128 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  31.76 
 
 		 221 aa  46.2  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  30.3 
 
 		 214 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  32.05 
 
 		 99 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  29.13 
 
 		 537 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  29.13 
 
 		 537 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  26.76 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1730  hypothetical protein  32.73 
 
 		 251 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  28.79 
 
 		 537 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  37.35 
 
 		 224 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  32.5 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  27.01 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  32.97 
 
 		 129 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  30.11 
 
 		 230 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  31.82 
 
 		 117 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  28.3 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  28.3 
 
 		 189 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  28.3 
 
 		 189 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  37.84 
 
 		 285 aa  42.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  24.84 
 
 		 358 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>