27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1892 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  27.8 
 
 		 576 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  38.61 
 
 		 416 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  39.49 
 
 		 481 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  34.16 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  34.16 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  35.81 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  35.81 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3577  hypothetical protein  33.54 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  27.17 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  29.81 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  27.12 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  27.92 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  26.75 
 
 		 240 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  29.01 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  36.78 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1472  hypothetical protein  26.53 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00176011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  29.59 
 
 		 351 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  26.75 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  31.87 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  28.93 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  28.57 
 
 		 358 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  32.14 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  31.58 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5365  hypothetical protein  31.11 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0349179 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  37.84 
 
 		 351 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>