28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1850 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  100 
 
 
351 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4429  hypothetical protein  65.55 
 
 
135 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.978681 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  38.03 
 
 
307 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  37.16 
 
 
296 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  38.57 
 
 
306 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4430  hypothetical protein  46.07 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  30.9 
 
 
302 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  27.62 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  31 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  34.78 
 
 
273 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  42.62 
 
 
273 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  29.59 
 
 
285 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  39.33 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01542  hypothetical protein  28 
 
 
236 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  36.07 
 
 
278 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  38.71 
 
 
290 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  40 
 
 
268 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  35.23 
 
 
263 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  27.54 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  31.96 
 
 
537 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  36.36 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  30.95 
 
 
199 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  35.05 
 
 
537 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  35.05 
 
 
537 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  34.72 
 
 
452 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  30.91 
 
 
245 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.354376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>