45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3898 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  84.03 
 
 		 240 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  84.03 
 
 		 240 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  46.64 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  36.08 
 
 		 290 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  34.15 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  36.27 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  34.63 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  35.47 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  33.17 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  36.88 
 
 		 268 aa  98.6  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  31.9 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  28.49 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  26.34 
 
 		 306 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  25.85 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  25.64 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  29.38 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  26.7 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  29.49 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  25.65 
 
 		 417 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  26.11 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  28.93 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  28.93 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  30.99 
 
 		 560 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  25.62 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  29.7 
 
 		 576 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  29.01 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  28.81 
 
 		 437 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  36.08 
 
 		 351 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  28.1 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  32.82 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  33.68 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  28.09 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  31.09 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  24.68 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  25.15 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  27.89 
 
 		 566 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  26.88 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04779  hypothetical protein  30.32 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  29.23 
 
 		 306 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  30.14 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  24.57 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  30.37 
 
 		 481 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  30.91 
 
 		 351 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>