27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3116 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  63.55 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  60.52 
 
 		 307 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  62.62 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  67.36 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  67.82 
 
 		 301 aa  355  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  60.19 
 
 		 305 aa  348  5e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  29.15 
 
 		 417 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  29.2 
 
 		 560 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  29.91 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  29.77 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  26.74 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  27.42 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  29.3 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  26.36 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  28.5 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  31.3 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  27.57 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  31.3 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  28.73 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  26.11 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  24.88 
 
 		 407 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  29.28 
 
 		 273 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  28.39 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  34.12 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  28.7 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  29.58 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>