29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2817 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  78.27 
 
 		 566 aa  868    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1152    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  36.5 
 
 		 407 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  27.74 
 
 		 306 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  29.92 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  27.34 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  30.08 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  28.27 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  31.61 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  26.44 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  28.24 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  26.76 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  35.88 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  23.79 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  27.49 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  29.93 
 
 		 305 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  26.15 
 
 		 215 aa  54.7  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  30.61 
 
 		 268 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  24.78 
 
 		 290 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  29.5 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  24.88 
 
 		 273 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  30.99 
 
 		 245 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  31.97 
 
 		 273 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  30.25 
 
 		 240 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  30.25 
 
 		 240 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  24.15 
 
 		 302 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  34.07 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  30.06 
 
 		 211 aa  44.3  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  23.24 
 
 		 302 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>