29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2182 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  78.69 
 
 		 299 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  68.75 
 
 		 296 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  68.23 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  63.09 
 
 		 301 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  62.84 
 
 		 307 aa  349  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  58.36 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  32.1 
 
 		 417 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  28.57 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  28.3 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  28.21 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  29.59 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  30.14 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  26.34 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  31.03 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  28.33 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  29.21 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  25.91 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  26.5 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  26.4 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  27.37 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  30.14 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  29.31 
 
 		 203 aa  52.8  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  27.72 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  30.41 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  31.33 
 
 		 358 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  26.97 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  22.22 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  28.3 
 
 		 351 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>