31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3657 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  100 
 
 		 417 aa  862    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  32 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  31.58 
 
 		 299 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  30.3 
 
 		 307 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  30.14 
 
 		 296 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  30.22 
 
 		 275 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  31.15 
 
 		 301 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  31.6 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  30.18 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  28.51 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  29.95 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  30 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  40 
 
 		 566 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  30.14 
 
 		 233 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  31.61 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  27.96 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  24.86 
 
 		 215 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  31.68 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  26.23 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  30.36 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  27.75 
 
 		 262 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  25.65 
 
 		 245 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  26.23 
 
 		 240 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  28.5 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  27.23 
 
 		 290 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  28.74 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  28.79 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  28.29 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  28.21 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  33.62 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  28.78 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>