29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3085 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1158    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  78.09 
 
 		 560 aa  868    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  34.46 
 
 		 407 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  35.68 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  29.32 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  28.24 
 
 		 306 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  27.78 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  23.97 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  27.56 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  25.72 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  26.69 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  33.81 
 
 		 437 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  25.31 
 
 		 263 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  29.89 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  30.07 
 
 		 273 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  24.64 
 
 		 278 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  53.9  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  25.48 
 
 		 302 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  26.62 
 
 		 262 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  36.96 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  32.5 
 
 		 273 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  24.77 
 
 		 215 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  27.89 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  33.71 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  28.89 
 
 		 211 aa  45.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  30.36 
 
 		 234 aa  44.3  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>