58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3275 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  80.95 
 
 		 273 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  70.22 
 
 		 290 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  71.06 
 
 		 263 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  59.26 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  47.21 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  33.46 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  39.82 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  37.31 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  37.31 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  34.65 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  31.63 
 
 		 576 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  31.55 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  30.43 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  32.45 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  36.26 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  30.21 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  30.07 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  29.07 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  29.55 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  27.54 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  30.13 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  28.88 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  29.57 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  31.47 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  28.5 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  32.5 
 
 		 566 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  31.97 
 
 		 560 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.05 
 
 		 1004 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  34.07 
 
 		 445 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  34.07 
 
 		 446 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  37.21 
 
 		 537 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  22.22 
 
 		 407 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  41.94 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  29.05 
 
 		 537 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  29.05 
 
 		 537 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  28 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  31.87 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  23.56 
 
 		 199 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  38.1 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2399  hypothetical protein  31.76 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252121  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  26.01 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  30.53 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  38.1 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  25.83 
 
 		 439 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  39.39 
 
 		 481 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  25 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  23.98 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  27.97 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  31.58 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  27.56 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  28.42 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.87 
 
 		 440 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1472  hypothetical protein  29.41 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00176011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  26.63 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  37.88 
 
 		 416 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3577  hypothetical protein  35.79 
 
 		 444 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>