23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10680 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  93.65 
 
 		 189 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  50.27 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  28.49 
 
 		 387 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  32.05 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  25.47 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  29.33 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  28.75 
 
 		 439 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  28.91 
 
 		 262 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  26.11 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  29.52 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  29.45 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  29.45 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  28.93 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  25.42 
 
 		 302 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04779  hypothetical protein  39.34 
 
 		 259 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  32.22 
 
 		 273 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  32.94 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  30.11 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  31.63 
 
 		 290 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  28.3 
 
 		 351 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  31.19 
 
 		 296 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  24.82 
 
 		 351 aa  41.2  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>