75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6360 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  100 
 
 		 296 aa  607  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  68.99 
 
 		 306 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  65.28 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  37.16 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4429  hypothetical protein  41.11 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.978681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  31.65 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  31.14 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  37.93 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  45.83 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  34.15 
 
 		 497 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  39.08 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  34.18 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  27.16 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  34.09 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  38.1 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  36.47 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  36.26 
 
 		 212 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  36.26 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  36.26 
 
 		 212 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  38.27 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  38.27 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  39.13 
 
 		 356 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  37.65 
 
 		 212 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  38.27 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  32.86 
 
 		 231 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  37.07 
 
 		 227 aa  52.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  34.15 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  35.77 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  30.07 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  37.68 
 
 		 193 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  34.07 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  36.25 
 
 		 463 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  38.46 
 
 		 405 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  31.54 
 
 		 240 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  31.54 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  32.91 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.03 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  34.57 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  34.48 
 
 		 197 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  28.75 
 
 		 122 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  30.77 
 
 		 479 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  33.75 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  32.14 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  31.78 
 
 		 207 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  36.47 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2072  hypothetical protein  37.5 
 
 		 413 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  28.09 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  29.07 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  32.5 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  33.72 
 
 		 196 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  33.68 
 
 		 273 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  30.49 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  30 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  33.33 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.43 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  28.95 
 
 		 100 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  25.3 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  30.77 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  30.49 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  29.06 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  35.11 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  27.97 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  30.49 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  31.4 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  32.26 
 
 		 537 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  31.19 
 
 		 189 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  23.84 
 
 		 200 aa  42.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>