60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0113 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  430  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  87.86 
 
 		 206 aa  386  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  83.82 
 
 		 207 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  76.38 
 
 		 212 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  76.38 
 
 		 212 aa  332  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  76.38 
 
 		 212 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  76.38 
 
 		 212 aa  331  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  66.67 
 
 		 280 aa  258  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  66.47 
 
 		 227 aa  247  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  60.23 
 
 		 193 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  60.11 
 
 		 196 aa  228  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  82.26 
 
 		 128 aa  214  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  54.26 
 
 		 230 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  52.41 
 
 		 356 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  44.21 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  43.02 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  46.67 
 
 		 214 aa  140  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  32.08 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  35.2 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  34.22 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  45.28 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  29.66 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  33.62 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  32.94 
 
 		 463 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  41.18 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  39.08 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  39.36 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  34.41 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  30.39 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.46 
 
 		 446 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  30.91 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  34.44 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  29.09 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34.02 
 
 		 339 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  28.12 
 
 		 132 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  28.32 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  41.38 
 
 		 340 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  30.95 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  30.95 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  31.37 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  30.95 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  29.31 
 
 		 341 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  28.21 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  29.41 
 
 		 462 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  23.74 
 
 		 277 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  31.76 
 
 		 405 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  28.92 
 
 		 100 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  31.19 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  31.71 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  28.69 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  31.76 
 
 		 479 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  26.09 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  32.46 
 
 		 266 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  24.32 
 
 		 123 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  46.94 
 
 		 295 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  44.26 
 
 		 244 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  44.26 
 
 		 244 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>