56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0115 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 
212 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  95.28 
 
 
212 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  95.28 
 
 
212 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  86.79 
 
 
212 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  75.37 
 
 
206 aa  330  9e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  83.24 
 
 
206 aa  327  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  76.04 
 
 
207 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  66.1 
 
 
280 aa  254  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  67.43 
 
 
227 aa  254  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  61.85 
 
 
193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  60.34 
 
 
196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  57.71 
 
 
230 aa  206  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  73.87 
 
 
128 aa  177  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  46.39 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  48.63 
 
 
356 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  40.57 
 
 
221 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  44.05 
 
 
214 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  33.49 
 
 
211 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  31.46 
 
 
208 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  31.89 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  41.67 
 
 
497 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  36.97 
 
 
334 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  41.49 
 
 
307 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  35.29 
 
 
463 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  29.41 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  42.05 
 
 
306 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  31.82 
 
 
462 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  36.26 
 
 
339 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  37.65 
 
 
296 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  31.76 
 
 
100 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  27.13 
 
 
446 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  35.14 
 
 
132 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  28.83 
 
 
266 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  36.47 
 
 
122 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  31.69 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  31.33 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  31.33 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  31.33 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  29.47 
 
 
132 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  34.07 
 
 
315 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  30.28 
 
 
479 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  34.09 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  32.29 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  31.82 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  29.36 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  33.09 
 
 
341 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  33.72 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  40.35 
 
 
340 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  27.88 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  29.84 
 
 
166 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  33.62 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  25.17 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  27.47 
 
 
99 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  47.5 
 
 
339 aa  41.6  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  26.05 
 
 
117 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>