86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1949 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 		 463 aa  928    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1967  hypothetical protein  30.22 
 
 		 426 aa  153  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1961  hypothetical protein  27.55 
 
 		 502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.159443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1971  hypothetical protein  26.37 
 
 		 474 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  37.21 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  44.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  44.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  44.16 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  41.38 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  36.17 
 
 		 111 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  39.24 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  34.09 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  35.42 
 
 		 877 aa  64.7  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  37.65 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  40.26 
 
 		 100 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  32.5 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  39.24 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  36.78 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  38.75 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  32.94 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  35.29 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  34.18 
 
 		 111 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  36.71 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  32.94 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  32.56 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  31.33 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  29.35 
 
 		 306 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  34.18 
 
 		 132 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  32.91 
 
 		 109 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  32.91 
 
 		 109 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  32.91 
 
 		 109 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  32.91 
 
 		 109 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  32.91 
 
 		 109 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  32.95 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  33.68 
 
 		 119 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  32.94 
 
 		 212 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  32.94 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  32.94 
 
 		 212 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  32.91 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  32.94 
 
 		 128 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  34.57 
 
 		 203 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  34.04 
 
 		 214 aa  54.7  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  32.94 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  32.18 
 
 		 196 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  35.23 
 
 		 197 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  36.9 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  34.48 
 
 		 230 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  35.8 
 
 		 296 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  32.47 
 
 		 351 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  38.82 
 
 		 227 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  36.25 
 
 		 315 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  34.41 
 
 		 340 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  36.47 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  32.88 
 
 		 113 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  31.25 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4222  tetratricopeptide TPR_2  35.87 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.356842  normal  0.550673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  32.88 
 
 		 113 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  30.59 
 
 		 193 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  30.12 
 
 		 245 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  31.51 
 
 		 113 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36 
 
 		 248 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  57.14 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  35.44 
 
 		 309 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  38.64 
 
 		 385 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  38.64 
 
 		 377 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  38.64 
 
 		 373 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  38.64 
 
 		 390 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  38.64 
 
 		 371 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  38.64 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  33.82 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  28.75 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  32.22 
 
 		 222 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4397  tetratricopeptide TPR_2  32.95 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  39.77 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  27.27 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  38.64 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4327  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 261 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  31.58 
 
 		 192 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  32.1 
 
 		 206 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  29.87 
 
 		 117 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  34.12 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  28.24 
 
 		 254 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  28.4 
 
 		 99 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  31.76 
 
 		 266 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>