93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7625 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  77.95 
 
 
341 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  78.25 
 
 
341 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  41.41 
 
 
339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0619  hypothetical protein  26.1 
 
 
331 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0699  hypothetical protein  26.1 
 
 
331 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.951363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  37.4 
 
 
479 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  50.53 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  45 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  43 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  43 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  43 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  43 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  43 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  31.43 
 
 
877 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  36.52 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  35.25 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  35.65 
 
 
307 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  34.53 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  35.56 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  38.37 
 
 
262 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  45.45 
 
 
266 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  31.46 
 
 
463 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  33.59 
 
 
207 aa  62.8  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  37.62 
 
 
132 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  40.45 
 
 
166 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  39.6 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  38.78 
 
 
117 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  28.74 
 
 
197 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  32.65 
 
 
203 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  31.91 
 
 
206 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  32.52 
 
 
212 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  39.53 
 
 
214 aa  60.1  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  42.35 
 
 
497 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  36.71 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  37.8 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  36.71 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  36.71 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  45.12 
 
 
557 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  33.68 
 
 
277 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  37.23 
 
 
245 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  41.41 
 
 
222 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  38.1 
 
 
117 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  41.38 
 
 
119 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  38.46 
 
 
254 aa  56.6  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  37.97 
 
 
111 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  30.39 
 
 
225 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  32.93 
 
 
225 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  35.56 
 
 
254 aa  56.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  34.15 
 
 
100 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  37.5 
 
 
197 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  33.33 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  38.1 
 
 
117 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  37 
 
 
206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  26.35 
 
 
405 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  40.58 
 
 
570 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  34.07 
 
 
99 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  37.37 
 
 
192 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  37.35 
 
 
405 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  39.18 
 
 
129 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  32.95 
 
 
122 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.61 
 
 
446 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  29.9 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  33.7 
 
 
221 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  33.71 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  32.93 
 
 
307 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  28.9 
 
 
230 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  34.74 
 
 
333 aa  46.6  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  28.1 
 
 
193 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  34.83 
 
 
434 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  36.27 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  34.18 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  36.27 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  34.83 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4803  hypothetical protein  39.44 
 
 
129 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  41.43 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  36.46 
 
 
129 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  36.08 
 
 
129 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  36.27 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  36.63 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  36.27 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  36.63 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  36.08 
 
 
129 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  35.85 
 
 
129 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  33.64 
 
 
129 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  36.27 
 
 
275 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  35.14 
 
 
113 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  34.48 
 
 
351 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>