48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11574 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  100 
 
 
197 aa  407  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  33.51 
 
 
214 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  35.83 
 
 
212 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  35.83 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  31.47 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  30.96 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  33.16 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  31.89 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  35 
 
 
206 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  29.73 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  32.16 
 
 
280 aa  79  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  30.81 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  26.03 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  37.23 
 
 
356 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  28.73 
 
 
208 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  33.64 
 
 
128 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  27.81 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  36.36 
 
 
497 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  36.26 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  37.78 
 
 
341 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  37.5 
 
 
334 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  30.68 
 
 
877 aa  52.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  34.21 
 
 
479 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  26.79 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  40.74 
 
 
315 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  36.08 
 
 
262 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  34.48 
 
 
296 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0544  hypothetical protein  44.44 
 
 
154 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  29.79 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  33.7 
 
 
225 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  35.8 
 
 
306 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  32.04 
 
 
462 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  28.72 
 
 
245 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  28.72 
 
 
245 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34.88 
 
 
339 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  26.61 
 
 
203 aa  44.7  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  27.91 
 
 
277 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  30.43 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  31.25 
 
 
100 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  30.53 
 
 
405 aa  43.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  28.71 
 
 
463 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  37.14 
 
 
341 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  26.19 
 
 
257 aa  42  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  29.41 
 
 
557 aa  41.2  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  31.71 
 
 
117 aa  41.2  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>