38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2090 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  700    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  54.44 
 
 		 280 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  53.01 
 
 		 207 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  54.6 
 
 		 230 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  53.09 
 
 		 206 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  51.2 
 
 		 212 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  47.92 
 
 		 227 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  52.5 
 
 		 212 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  52.5 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  50.62 
 
 		 193 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  48.63 
 
 		 212 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  51.85 
 
 		 196 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  55.05 
 
 		 128 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  40.99 
 
 		 197 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  29.18 
 
 		 221 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  38.17 
 
 		 214 aa  94  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  37.32 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3002  hypothetical protein  48.48 
 
 		 113 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.292097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  41.76 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  37.23 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  39.13 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  39.13 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  32.61 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  36.47 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  38.82 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  37.65 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  35.63 
 
 		 100 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  36.14 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  55.32 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  34.94 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  34.94 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  37.65 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  29.31 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2023  hypothetical protein  42.11 
 
 		 716 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  34.44 
 
 		 122 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>