50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2752 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  406  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  58.82 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  58.38 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  60.23 
 
 		 206 aa  241  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  58.7 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  58.7 
 
 		 212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  58.7 
 
 		 212 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  59.54 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  56.67 
 
 		 280 aa  224  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  56.98 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  52.97 
 
 		 230 aa  200  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  52.02 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  49.38 
 
 		 356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  43.01 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  41.95 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  56.73 
 
 		 128 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  39.52 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  29.61 
 
 		 208 aa  95.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  33.5 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  26.26 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  41.51 
 
 		 497 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  33.91 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  36.36 
 
 		 405 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  37.68 
 
 		 296 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  29.47 
 
 		 132 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  33.73 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  29.73 
 
 		 123 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  30.59 
 
 		 463 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  31.33 
 
 		 351 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  32.43 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  30.91 
 
 		 462 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  32.1 
 
 		 340 aa  48.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  32.53 
 
 		 245 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  32.53 
 
 		 245 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  30.34 
 
 		 100 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  27.27 
 
 		 339 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  26.52 
 
 		 341 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  28.21 
 
 		 334 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  32.53 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  26.37 
 
 		 99 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  24.18 
 
 		 877 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  27.27 
 
 		 117 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  30.26 
 
 		 557 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  28.26 
 
 		 129 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4803  hypothetical protein  28.26 
 
 		 129 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  31.76 
 
 		 306 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  27.61 
 
 		 341 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  26.8 
 
 		 117 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  27.97 
 
 		 405 aa  41.2  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>