52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2487 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  205  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  67.74 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  67.37 
 
 		 117 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  55.1 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  55.1 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  55.1 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  55.1 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  55.1 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  48.39 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  48.35 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  46.07 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  47.25 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  52.56 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  52.56 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  44.83 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  43.68 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  38.1 
 
 		 462 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  39.78 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  39.78 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  39.78 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  39.78 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  39.78 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  39.78 
 
 		 406 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  39.78 
 
 		 275 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  39.78 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  32.97 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  36.46 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  32.56 
 
 		 479 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  30.59 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  29.21 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  28.89 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  35.29 
 
 		 339 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  34.48 
 
 		 341 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  29.21 
 
 		 225 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  28.72 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  28.41 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  32.05 
 
 		 351 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  43.9  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  32.56 
 
 		 497 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  28.4 
 
 		 463 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  30.85 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  26.37 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  29.63 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  27.47 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  30.61 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  30 
 
 		 877 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  29.29 
 
 		 254 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  25.27 
 
 		 206 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  28.28 
 
 		 356 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>