81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5697 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  251  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  56.25 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  55.43 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  56.98 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  48.51 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  48.51 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  48.51 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  48.51 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  48.51 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  46.07 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  43 
 
 		 119 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  48.91 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  47.5 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  47.5 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  46.25 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  38.68 
 
 		 462 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  35.64 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  44.09 
 
 		 385 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  44.09 
 
 		 377 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  44.09 
 
 		 373 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  44.09 
 
 		 390 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  44.09 
 
 		 371 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  44.09 
 
 		 275 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  43.01 
 
 		 406 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  33.64 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  39.51 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  36.36 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  40.22 
 
 		 315 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  43.33 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  37.63 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  37.8 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  29.21 
 
 		 463 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  34.71 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  35.44 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  29.81 
 
 		 277 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  32.32 
 
 		 221 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  32.38 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  32.71 
 
 		 341 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  32.69 
 
 		 497 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  35.56 
 
 		 231 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  35.56 
 
 		 262 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  38.2 
 
 		 877 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  29 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  32.5 
 
 		 211 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  36.14 
 
 		 272 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  32.91 
 
 		 225 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  31.33 
 
 		 306 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  34.52 
 
 		 245 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  34.52 
 
 		 245 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  30.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  32 
 
 		 309 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  33.33 
 
 		 245 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  27.73 
 
 		 208 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  31.03 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  27.93 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  35.42 
 
 		 446 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  27.35 
 
 		 405 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  32 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  34.48 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  30.49 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 434 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  29.57 
 
 		 230 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  26.36 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  27.12 
 
 		 212 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  26.67 
 
 		 207 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  29.27 
 
 		 257 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  33.77 
 
 		 351 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  24.53 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0619  hypothetical protein  28.83 
 
 		 331 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0699  hypothetical protein  28.83 
 
 		 331 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.951363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  25.38 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  26.36 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  32.32 
 
 		 192 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  29.35 
 
 		 340 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>