60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1756 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  99.64 
 
 
371 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  99.27 
 
 
406 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  99.64 
 
 
390 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  99.64 
 
 
385 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  99.64 
 
 
377 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  99.64 
 
 
373 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  89.82 
 
 
418 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  47.06 
 
 
129 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  41.44 
 
 
123 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  45.63 
 
 
119 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  39.82 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  39.82 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  39.82 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  39.82 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  39.82 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  39.78 
 
 
99 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  40.91 
 
 
111 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  38.14 
 
 
341 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  38.24 
 
 
462 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  42.05 
 
 
111 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  35.87 
 
 
479 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  32.73 
 
 
122 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  35.29 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  35.29 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  38.32 
 
 
117 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  38.64 
 
 
463 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  35.29 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  36.56 
 
 
132 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  32.14 
 
 
203 aa  55.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  35 
 
 
100 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  34.55 
 
 
117 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  40.23 
 
 
117 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  34.82 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  36.44 
 
 
341 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4274  hypothetical protein  39.78 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.162287 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  37 
 
 
334 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  31.87 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  36.84 
 
 
113 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  30.83 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  36.84 
 
 
113 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  35.87 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  36.78 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  33.7 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  32.12 
 
 
166 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  29.46 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  28.27 
 
 
212 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  36.17 
 
 
225 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  34.82 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  29.09 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  45.65 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  30.95 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  34.21 
 
 
113 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  27.19 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  32.14 
 
 
497 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  31.08 
 
 
262 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  31.62 
 
 
212 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>