33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0009 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  510  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  35.43 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4883  hypothetical protein  47.32 
 
 		 139 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85807  normal  0.0116813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2299  hypothetical protein  47.22 
 
 		 133 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4650  hypothetical protein  39.47 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  40 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  54.55 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  29.73 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  40.85 
 
 		 334 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3742  hypothetical protein  30.48 
 
 		 134 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.457714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  26.81 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  36.62 
 
 		 479 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  30.12 
 
 		 463 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  45.76 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  40.32 
 
 		 128 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  35.8 
 
 		 557 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  35.96 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  37.35 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  33.71 
 
 		 100 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  34.94 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  32.98 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  35.56 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  30.43 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  41.82 
 
 		 405 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  29.89 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  40.32 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 		 436 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  44.19 
 
 		 339 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  39.06 
 
 		 497 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  26.98 
 
 		 206 aa  42  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  25.76 
 
 		 212 aa  42  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>