61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0108 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  87.86 
 
 		 206 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  82.84 
 
 		 207 aa  364  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  75.37 
 
 		 212 aa  330  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  74.38 
 
 		 212 aa  328  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  74.38 
 
 		 212 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  78.61 
 
 		 212 aa  325  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  65 
 
 		 280 aa  252  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  96.77 
 
 		 128 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  66.47 
 
 		 227 aa  245  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  60.23 
 
 		 193 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  57.87 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  50 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  174  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  43 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  40.78 
 
 		 221 aa  153  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  43.9 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  33.52 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  32.32 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  33.16 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  42.71 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  31.06 
 
 		 405 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  30.28 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  37.63 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  32.94 
 
 		 463 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  32.76 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  37.78 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  36.47 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.46 
 
 		 446 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  30.19 
 
 		 262 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  28.97 
 
 		 462 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  41.38 
 
 		 340 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  28.95 
 
 		 479 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  36.47 
 
 		 307 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  26.81 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  32.69 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  29.47 
 
 		 132 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  30.12 
 
 		 100 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  28.04 
 
 		 257 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  35.29 
 
 		 315 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  30.06 
 
 		 341 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  33.12 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  28.97 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  31.87 
 
 		 339 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  29.21 
 
 		 351 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  32.43 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  29.76 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  29.76 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  29.76 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  27.12 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  31.67 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4327  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 261 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  26.67 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  27.93 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  31.58 
 
 		 557 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4222  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.356842  normal  0.550673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  26.96 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  33.06 
 
 		 203 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  25.26 
 
 		 117 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>