38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0757 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  100 
 
 		 280 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  54.44 
 
 		 356 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  66.67 
 
 		 206 aa  258  9e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  66.1 
 
 		 212 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  65 
 
 		 206 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  65.54 
 
 		 212 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  57.64 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  64.97 
 
 		 212 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  64.09 
 
 		 207 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  63.69 
 
 		 227 aa  235  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  57.39 
 
 		 193 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  58.76 
 
 		 196 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  54.14 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  42.03 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  43.96 
 
 		 197 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  40.51 
 
 		 214 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  57.73 
 
 		 128 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  36.07 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  35.03 
 
 		 208 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3002  hypothetical protein  55 
 
 		 113 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.292097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  32.16 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  39.13 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  33.64 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  34.07 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  27.96 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3124  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2332  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1455  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  34.04 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  36.47 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3239  hypothetical protein  32.35 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316074  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1371  hypothetical protein  32.35 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  26.15 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1091  hypothetical protein  38.89 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57137  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  36.47 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  36.47 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  38.24 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  31.52 
 
 		 122 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>