53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  100 
 
 
221 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  42.93 
 
 
207 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  42.03 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  43.09 
 
 
206 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  41.95 
 
 
193 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  37.44 
 
 
212 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  38.71 
 
 
212 aa  151  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  37.97 
 
 
212 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  37.43 
 
 
212 aa  147  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  42.46 
 
 
196 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  42.69 
 
 
227 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  39.27 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  37.22 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  39.42 
 
 
356 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  37.17 
 
 
128 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  29.15 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  28.14 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  25.14 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  26.56 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  37.74 
 
 
497 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  45.83 
 
 
296 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  30.08 
 
 
123 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  38.46 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  30.39 
 
 
315 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  27.72 
 
 
257 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  37.93 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  32.94 
 
 
463 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  26.67 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  30.85 
 
 
100 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  29.21 
 
 
99 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  35.62 
 
 
132 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  31.15 
 
 
446 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  31.37 
 
 
341 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  35.63 
 
 
307 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  31.76 
 
 
351 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  29.17 
 
 
479 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  29.41 
 
 
462 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  34.88 
 
 
306 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  32.39 
 
 
245 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  29.73 
 
 
111 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  28.57 
 
 
117 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  25.76 
 
 
266 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  28.12 
 
 
339 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  31.48 
 
 
262 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  28.89 
 
 
111 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  33.77 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  27.55 
 
 
122 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>