93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1865 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  93.33 
 
 		 225 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  36.62 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  39 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  40.78 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  38.38 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  38.38 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  37.65 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  31.62 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  40.79 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  43.33 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  37.5 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  36.08 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  36.29 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  35.35 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  34.78 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  34.82 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  36.27 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  35.35 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  37.65 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  36.73 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  32.89 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  40.24 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  39.53 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  38.46 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  33.91 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.58 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  38.78 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  42.31 
 
 		 100 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  33.59 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  40.79 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  37.65 
 
 		 307 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  33.02 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  38.14 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  38.96 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  38.96 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0942  hypothetical protein  39.6 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 877 aa  52  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  36.79 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  35.53 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  38.89 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  38.89 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  35 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  39.02 
 
 		 117 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2023  hypothetical protein  35.56 
 
 		 716 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  31 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  38.89 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  34.62 
 
 		 341 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  38.03 
 
 		 434 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  40.62 
 
 		 356 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4397  tetratricopeptide TPR_2  37.62 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  32.29 
 
 		 192 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  35.8 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  25.81 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  33 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  33.75 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  29.67 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  32.61 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  34.38 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  33.73 
 
 		 122 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  31.33 
 
 		 99 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  30.19 
 
 		 117 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  55.88 
 
 		 405 aa  46.2  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  31.25 
 
 		 306 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  31 
 
 		 109 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  35.44 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  31 
 
 		 109 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  31 
 
 		 109 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  31 
 
 		 109 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  31 
 
 		 109 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  28.18 
 
 		 117 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  31.25 
 
 		 446 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  35.61 
 
 		 418 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  31.63 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  37 
 
 		 406 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  37 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  38.33 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  37 
 
 		 373 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  41.43 
 
 		 413 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  37 
 
 		 390 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  37 
 
 		 377 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  37 
 
 		 371 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  37 
 
 		 385 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  39.71 
 
 		 570 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  29.47 
 
 		 462 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  34.34 
 
 		 245 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4327  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 261 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>