36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2870 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 		 333 aa  682    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  25.99 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3593  hypothetical protein  26.09 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  43.56 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  23.08 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  33.78 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  35.37 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  32.89 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6292  hypothetical protein  41.75 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  44.44 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1787  hypothetical protein  41.75 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  28.44 
 
 		 132 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1811  hypothetical protein  39.81 
 
 		 280 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  36.27 
 
 		 131 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  33.96 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  23.72 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  26.99 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  35.45 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  26.03 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  26.76 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  26.39 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  25.71 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0619  hypothetical protein  26.6 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  30.11 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0699  hypothetical protein  26.6 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.951363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  34.18 
 
 		 462 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  29.85 
 
 		 463 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  34.07 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>