36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5742 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  33.33 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  37.18 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  37.36 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  34.09 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  36.78 
 
 
497 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  31.58 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  28.42 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4274  hypothetical protein  31.11 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.162287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  32.93 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  34.44 
 
 
132 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  32.08 
 
 
405 aa  50.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  32.94 
 
 
339 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  36.14 
 
 
123 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  29.57 
 
 
462 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  35.05 
 
 
418 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  27.96 
 
 
132 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  32.29 
 
 
225 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  31.87 
 
 
385 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  31.87 
 
 
377 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  31.87 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  31.87 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  31.87 
 
 
390 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  31.87 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  31.87 
 
 
406 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  30.56 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  32.29 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.33 
 
 
436 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  32.29 
 
 
100 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  30.86 
 
 
570 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  31.52 
 
 
446 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  30.77 
 
 
208 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0699  hypothetical protein  31.08 
 
 
331 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.951363  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0619  hypothetical protein  31.08 
 
 
331 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  30.59 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>