61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1387 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  276  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  36.54 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  37.65 
 
 
463 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  39.56 
 
 
339 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  35.65 
 
 
341 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  37 
 
 
334 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  41.57 
 
 
277 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  39.18 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  37.62 
 
 
315 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  34.02 
 
 
877 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  33.72 
 
 
254 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  35.65 
 
 
341 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  36.96 
 
 
257 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  31.11 
 
 
225 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  35.23 
 
 
262 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  34.09 
 
 
266 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  31.62 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  31.63 
 
 
266 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  35.14 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  31.82 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  32.38 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  34.78 
 
 
306 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  33.66 
 
 
192 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  33.96 
 
 
446 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  30.69 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  37.25 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  28.44 
 
 
333 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  34.44 
 
 
272 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  34.38 
 
 
405 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  32.98 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  28.57 
 
 
479 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  35.29 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  33.65 
 
 
222 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  32.29 
 
 
206 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  32.97 
 
 
497 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  31.73 
 
 
462 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  33.96 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  32.97 
 
 
309 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  30.1 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  32.94 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  29.57 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  29.57 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  29.57 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  29.57 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  29.57 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  26.27 
 
 
208 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  29.73 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4274  hypothetical protein  33.73 
 
 
283 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.162287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  31.25 
 
 
207 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  33.63 
 
 
129 aa  43.9  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  34.07 
 
 
196 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  30.95 
 
 
296 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  34.74 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0699  hypothetical protein  28.57 
 
 
331 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.951363  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0619  hypothetical protein  28.57 
 
 
331 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  31.58 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  30.77 
 
 
307 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  30.53 
 
 
405 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>