22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1462 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  39.16 
 
 
276 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1787  hypothetical protein  38.43 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6292  hypothetical protein  38.43 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1811  hypothetical protein  38.04 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  40.51 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  36.71 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  40.79 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  35.58 
 
 
497 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  33.91 
 
 
136 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  27.61 
 
 
479 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  35.87 
 
 
434 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  36.67 
 
 
222 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  38.75 
 
 
135 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  41.54 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  38.96 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  31.58 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  41.03 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  41.43 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  25.2 
 
 
405 aa  43.1  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  36 
 
 
463 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  31.25 
 
 
197 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>