19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1811 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1811  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  563  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1787  hypothetical protein  94.29 
 
 
280 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6292  hypothetical protein  94.29 
 
 
280 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  80.22 
 
 
276 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  38.37 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1724  hypothetical protein  63.33 
 
 
98 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  41.18 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  49.23 
 
 
497 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  37.65 
 
 
341 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  40 
 
 
479 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  41.89 
 
 
446 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  31 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  35.11 
 
 
434 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  40.68 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  42.37 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  35 
 
 
309 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  31.03 
 
 
132 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  34.15 
 
 
122 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4397  tetratricopeptide TPR_2  39.19 
 
 
253 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>